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Creo que te refieres a la "indivisibilidad" del átomo, la cual fue refutada mediante el descubrimiento de el átomo de radio, y los quarks, las cuales son partículas que forman parte de el proton, neutron y el electron.
La invisibilidad del átomo se refutó con los microscopios.
El descubrimiento que refutó la idea de la indivisibilidad del átomo fue el descubrimiento del electrón por Joseph Thomson.
Después de la teoría atómica de Dalton surgieron descubrimientos como el de la electricidad y la radiactividad los cuales permitieron refutar la idea de indivisibilidad del átomo. Fue así como Thomson, mediante el tubo de rayos catódicos concluyó que los rayos catódicos eran haces de partículas a las que llamó electrones.
Posteriormente, Eugen Golstein descubrió los protones con lo cual se daba la idea de que el átomo estaba formado por partículas aún más pequeñas.
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