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Son muchos los descubrimientos donde el microscopio ha tenido un papel relevante; a continuación se enumeran algunos de ellos:
- Descubrimiento de las neuronas, como estructura funcional del sistema nervioso.
- Estudio de las células vivas.
- Descubrimiento del virus del papiloma humano, uno de los responsables del cáncer del cuello del útero.
- Descubrimiento de las propiedades del Grafeno, un metal que ha resultado ser el mejor conductor de electricidad, y el más económico.
- Análisis de las proteínas de las células vivas.
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