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El microscopio electrónico es aquél que utiliza electrones en lugar de fotones o luz visible para formar imágenes de objetos diminutos. En este sentido, en los microscopios electrónicos mas modernos se pueden ver imágenes de hasta unas 5000 veces más ampliadas que con los microscopios ópticos de mayor gama, debido a que, la longitud de onda de los electrones es mucho menor que la de los fotones visibles.
El microscopio óptico es un microscopio que, como su nombre indica, está basado en lentes ópticos. También es conocido como microscopio de luz, ya que, utiliza luz o «fotones» o microscopio de campo claro. Este es un instrumento que tiene más de una lente de objetivo y es empleado para examinar objetos transparentes o laminas muy finas mediante un sistema de lentes y fuentes de iluminación.
