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La principal diferencia entre evolución paralela y reticulada es que, en la evolución paralela hace referencia esencialmente a la homoplasia que cosiste en una evolución diferente de dos cosas semejantes y el paralelismo y la homoplasia hacen referencia a que dos caracteres son homoplásticos cuando en grupos filogéneticamente lejanos hay analogía.
Y la evolución reticulada es básicamente especiación por hibridación que es forma extrema de transferencia genética horizontal, es decir que para que se lleve a cabo una evolución, es necesario depender de otro factor.
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