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Yo leí ese cuento y te puedo dar mi opinión de él, aunque te aclaro que no soy una especialista en esto.
A mi me parece que el cuento habla en general de los límites que tiene la aplicación del método científico en algunos campos lejanos a las ciencias exactas. Vale decir, el método cientifico implica:la observación del fenómeno, la delimitación del contexto, la formulación de la hipótesis y la experimentación (hecho por el cual se prueba un fenómeno) para así arribar a una conclusión final. Fijate que todos estos pasos los aplica el autor para explicar esa"rareza" de que una mosca pueda volar al revés.
Creo que él hace alusión a que hay muchas cosas que escapan al entendimiento y a la razón humana, fenómenos, situaciones que no se pueden explicar, pero eso no quita que existan o sucedan.
Si tuviera que aplicar un simbolismo propio de él, diría que tal vez los poetas, los escritores se comportan a veces como las "moscas" del cuento, porque son vistos como "bichos raros", Cortázar mismo solía decirlo, ven el mundo al revés, o con otros ojos diferentes a los de las personas racionalistas, a los tecnócratas, a los matemáticos... Y sin embargo hay están, conviven con nosotros, en un mismo espacio, en un mismo tiempo solo que su óptica del mundo y el universo es la que cambia. Y a lo mejor la idea no es tratar de entender porque esto sucede sino más bien disfrutar de su "vuelo"distinto. A veces la presencia de un testigo no sirve para probar un fenómeno, ya que ese testigo puede ser veraz ó puede falsear la verdad, pero un testigo es siempre cómplice de un hecho que puede llegar a ser extraordinario y único, para él.
Fijate que al final del cuento su amigo le dice:"Pero en realidad esa mosca sigue volando como cualquier mosca, sólo que le tocó ser la excepción. Lo que ha dado media vuelta es todo el resto".
Quizás todo en la vida depende de la óptica con que te decidas a mirarla!
Bueno espero que te sirva, pero es mi humilde opinión del cuento.
Saludos
Explicación✌️