Respuestas
En 1876, alejado del mundo de la política, funda el colegio La Paz desde donde realiza una destacada labor educativa. En 1884 escribe una Gramática castellana y en 1887 Homófonos de la lengua castellana. En 1889, como comisionado por el Ejecutivo Nacional, presenta un informe al ministro de Instrucción Pública para la formación de un catálogo de libros de instrucción popular en Venezuela por iniciativa privada. También en 1889, fue nombrado ministro de Instrucción Pública por el entonces presidente de la República Juan Pablo Rojas Paúl. En 1892, es designado presidente del Consejo Federal en el gobierno de Raimundo Andueza Palacio, tocándole asumir la presidencia interina de la República durante el estallido de la Revolución Legalista dirigida por Joaquín Crespo.
Tras la salida de Andueza del país y el triunfo del movimiento liderado por Crespo, sale al exilio para regresar ya retirado definitivamente de la política. En 1895, fue publicado su trabajo más importante sobre instrucción popular: Primer libro venezolano de literatura, ciencias y bellas artes. El 6 de octubre de 1901, fue designado para ser incorporado como individuo de número de la Academia Nacional de la Historia, lo cual no se pudo efectuar debido a la avanzada edad de Villegas.
Desde 1906 hasta 1907, fue cónsul de Venezuela en la isla de Trinidad y presidente de la Cámara de Diputados en 1909. En 1912 hasta 1934, se desempeñó como presidente interino de la Orden del Libertador, fue decano de la Facultad de Ciencias Políticas, Vicerrector de la Universidad Central de Venezuela (1930-1933) y miembro fundador de la Academia de Ciencias Políticas y Sociales, se incorporó en 1915, presidiendola en tres oportunidades.