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El flujo de materia y energía en el ecosistema en Las Lomas de Lachay es un proceso cíclico y radicalmente marcado por las diferencias que presenta su vegetación y la fauna.
Ya que la flora y fauna son especies endémicas, (propias de esta región) y la reserva posee un clima estacional o húmedo, el flujo recorre el ecosistema de manera coordinada y simultánea con la absorción del sol y el agua como principales fuentes de energía. En cuanto a la materia, fluye por el suelo a través de la alimentación de las especies y posteriormente a las heces depositadas por estos, contribuyendo con ello, al reinicio del ciclo.
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