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Los pasos que aplicó Leeuwenhoek del método ciéntifico, fueron basicamente la observación, una nivel de experimentación acorde a la época y la documentación organizada de tales observaciones, faltando en muchos casos la formulación de hipótesis y la elaboración de conclusiones y era muy renuente a compartir sus hallazgos.
Su técnica para la elaboración de lentes para los microscopios que le sirvieron para descubrir la microbiólogía, nunca fue revelada, y su falta de preparación academico - científica, hizo que muchos de sus hallazgos no fueran comprendidos de un todo por el mismo, lo cual no impidió que fuera considerado el padre de la microbiología.
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