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En el año 1860, Tomás Cipriano se enfrentó a Mariano Ospina por causa de unas medidas que tomó el segundo de los mencionados desde la presidencia de la república. Cipriano era el líder del grupo opositor liberal en tanto que Ospina encabezaba el gobierno conservador.
Este enfrentamiento comenzó a gestarse en el año 1856 cuando un grupo de conservadores moderados y liberales radicales formaron una coalición que llamaron Partido Nacional. Esta coalición lanzó la candidatura presidencial del general Tomás Cipriano de Mosquera en contra de la de Mariano Ospina Rodríguez, del partido conservador y de Manuel Murillo Toro apoyado por los liberales más radicales.
Estas elecciones fueron ganadas por Mariano Ospina Rodríguez quien impuso una política centralista. El resto de las regiones vió así perder muchas de sus atribuciones, lo que causó una creciente tensión política. El desenlace fue el ataque a la capital de las fuerzas liberales encabezadas por Tomás Cipriano. Este enfrentamiento fué el punto de arranque de lo que se llamó Guerra civil colombiana entre los años 1860 y 1862 y desembocó en la creación de los Estados Unidos de Colombia en 1863.