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La frase se quiere con el corazón y se piensa con la cabeza quiere decir que los sentimientos y la razón no deben mezclarse.
En general, las personas re refieren al corazón para hablar sobre sentimientos y estados de ánimo, y a la cabeza para referirse a los pensamientos y decisiones racionales.
Se quiere con el corazón y se piensa con la cabeza separa los sentimientos y las razones, clasificándolas como cosas diferentes, es decir, que no deben mezclarse porque son de naturaleza diferente. La frase también significa que si se mezclan los sentimientos con las decisiones que deben ser razonadas o pensadas, es muy probable que no se tome una buena decisión, porque los sentimientos, buenos o malos, que tenemos hacia una persona pueden hacer que nos inclinemos a decisiones guiadas por los sentimientos y no por lo que es mas conveniente o razonable.