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Los lisosomas tienen una estructura muy sencilla, "semejantes" a vacuolas, rodeados solamente por una membrana, contienen gran cantidad de enzimas digestivas que degradan todas las moléculas inservibles para la célula.
Funcionan como "estómagos" de la célula y además de digerir cualquier sustancia que ingrese del exterior, vacuolas digestivas (figura, números 4 y 5), ingieren restos celulares viejos para digerirlos también (número 3), llamados entonces vacuolas autofágicas.
Llamados "bolsas suicidas" porque si se rompiera su membrana, las enzimas encerradas en su interior, terminarían por destruir a toda la célula.
Los lisosomas se forman a partir del Retículo endoplásmico rugoso (número 1)y posteriormente las enzimas son empaquetadas por el Complejo de Golgi (número 2).