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- Las Archaea es similar a Bacteria en la mayoría de los detalles de la estructura y del metabolismo de la célula, pero difiere sobre todo en la composición de los LÍPIDOS de la membrana celular y en los aspectos GENÉTICOS
- La TRANSCRIPCIÓN y TRADUCCIÓN genéticas. La TRADUCCIÓN usa factores de iniciación y de alargamiento del tipo eucarionte y la TRANSCRIPCIÓN implica PROTEÍNAS de unión TATA y TFIIB como en los eucariontes.
- Muchos GENES ARNr y ARNt de las archaea poseen INTRONES únicos que no se encuentran ni en eucariontes ni en bacterias.
- Las archaea poseen FOSFOLÍPIDOS basados en GLICEROL, pero con 3 características que los hacen únicos, ESTEREOQUÍMICA del GLICEROL ,ENLACES ÉTER, CADENAS ISOPRENOIDES.
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Bacterias: la membrana celular contiene enlaces éster; la pared celular está hecha de peptidoglicano; tienen sólo una ARN polimerasa; reaccionan a los antibióticos de una manera diferente que las arqueas.