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Desde hace aproximadamente 300 millones de años cuando el continente americano se separo de Pandora (super continente ), el teeritorio que hoy conocemos como el Istmo de Panamá inicio su formación. Cuando este territorio surgió de entre las aguas del océano se convirtió en el puente que conecto América del Norte con América del Sur, y permitió la migración de estas las especies animales del norte al sur del continente.
A este fenómeno migratorio se le conoce como el Gran Intercambio Biótico Americano e inicio hace aproximadamente 50 millones de años, y aun muchas especies hoy en día recorren esta ruta migratoria.
Entre las especies que conforman la fauna del Istmo de Panamá las siguientes se encuentran en peligro de extinción, por la destrucción y contaminación de su habita, caza furtiva y venta en el mercado negro:
1) puma
2)Mono titi
3)manatí
4)aguila arpia
5) mono cara blanca
6)Tortuga caguama