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Los grupos fosfato están unidos a los carbonos 5' y 3' de cada azúcar de la cadena de ADN. Un final de la cadena lleva un grupo fosfato libre pegado al carbono 5'; a este se le llama extremo 5' de la molécula. El otro final tiene un grupo hidroxilo libre (-OH) en el carbono 3' y se le llama extremo 3' de la molécula.
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