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Alejandro alzó su copa de vidrio, y la observó como siempre lo hacía, con admiración y un ligero gesto de incredulidad. Hacía ya dos años que había llegado a la escuela pitagórica de Crotona, en busca de la explicación última del mundo. Desde su infancia, Alejandro se preguntaba como era posible que aquella piedra dura y de color oscuro, se transformara bajo la acción del fuego purificador, en ese otro material translucido, brillante y quebradizo que formaba su copa. ¿Qué era el fuego para ser capaz de transformar así la materia? ¿Y qué era ésta? ¿Cómo explicar los cambios que en ella tenían lugar? Su maestro, Pitágoras, estaba convencido de la existencia de un mundo de números y figuras poliédricas tridimensionales, que eran la esencia de todas las cosas. Pero, a veces, todo eso le resultaba tan distante, tan sumamente diferente de la copa que sostenía entre sus manos, que le resultaba difícil creerlo. Alejandro no lo sabe, pero todavía faltan más de dos milenios para que el mundo pitagórico de los números y estructuras tridimensionales, pueda relacionarse con la materia y sus procesos de cambio. Faltan más de dos milenios para el nacimiento de la Química Cúantica.
La Química Cuántica es el área de conocimiento que relaciona el mundo pitagórico de la matemática con la materia formada por átomos y moléculas. Es la teoría de la Química por excelencia. Cabría preguntarse sobre el sentido y la necesidad de una teoría en una área de conocimiento experimental como la Química. Ante eso podemos decir, que la teoría nos proporciona un lenguaje para conceptualizar y contextualizar la experiencia, y sin lenguaje, no hay ciencia ni conocimiento humano. La naturaleza sólo nos da unos datos que hay que interpretar, y esa interpretación se realiza dentro de un marco teórico. Pero además, el lenguaje y la teoría moldea nuestras mentes para que podamos no sólo entender el experimento, sino que podamos hacer las preguntas adecuadas. Así, en cada rama científica adquirimos una manera de racionalizar el experimento ligeramente diferente. Como consecuencia, aquellas áreas de conocimiento que se encuentran en la frontera entre varias ramas científicas ofrecen una rica variedad de conceptos, no siempre coherentes entre sí, pero que aportan su punto de vista a la comprensión del hecho experimental. La Química Cuántica es una de estas áreas.
La Química Cuántica puede ser definida como un triángulo surgido de la interacción de tres áreas científicas, representadas en cada uno de los lados : 1) la Mecánica Cuántica que aporta la teoría interpretativa y es la base del lenguaje en Química Cuántica 2) la Química que proporciona el experimento que hay que interpretar, y 3) la Computación que, hoy en día, nos suministra la tecnología necesaria para relacionar teor