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Dentro de nuestro organismo existen una gran cantidad de seres vivos de los cuales no estamos conscientes, pues estos solo son visibles a través de un microscopio debido a su tamaño. Algunos de estos microorganismos que habitan naturalmente en nuestro cuerpo son: las bacterias, virus, hongos y parásitos.
A pesar de que se encuentran de forma natural en nuestro organismo, algunos pueden ser beneficiosos ya que protegen al cuerpo y contribuyen a su buen funcionamiento, por ejemplo los que encontramos localizados en la vagina, estos producen ácido láctico previniendo así infecciones por hongos. Otros pueden ser patógenos, los cuales ocasionan enfermedades, pues infectan nuestras células, de hecho pueden matarlas. Mayormente ocurre con bacterias, virus y hongos.