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Los procesos metabólicos que realizan las arqueas implican la utilización de diferentes sustancias del ambiente lo cual las vinculan con el ciclo de los elementos en la biosfera. Recientemente se ha demostrado que un grupo de Crenarchaetoa Marina es capaz de realizar la nitrificación, lo que es un rasgo anteriormente desconocido en las Arqueas, y hoy se sabe que convierten el nitrógeno atmosférico en amoniaco, proceso muy importante para la vida. El hombre además las utiliza en diferentes procesos industriales como la minería, la biotecnología, la conservación del medio ambiente entre otros.
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