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Franja montañosa: alcanza las zonas de alta y baja montaña, la zona de alta montaña se forma de una serie de mesetas que muestran en sus laderas una inclinación de unos 45 grados, se hallan a unas altitudes que inician en los 4000 metros, consiguiendo superar inclusive los 6000 metros de altura sobre el nivel del mar en algunos de los picos más alto de los Andes, entre estos tenemos: el monte Verónica, a 5682 metros de altura, el Tucarhuay a 5910 metros, mientras que el punto más alto se encuentra en la cima del Jatun Ausangate al sur, en la cordillera de Vilcanota, con temperaturas que lleguan a alcanzar niveles por debajo de los cero grados, en donde el viento barre sin parar las planicies de ichu y donde las rocas se pueblan de líquenes y musgo.
Franja forestal: la jungla del Machu Picchu alcanza las zonas que se encuentran en las latitudes entre los 800 y los 2000 metros de altura, el clima tropical propio de esta zona provee temperaturas suaves todo el año, así como elevados niveles de humedad en el ambiente, excelentes para la reproducción de todo tipo de vegetación, los bosques enanos, un escenario de árboles retorcidos, aquí los árboles son pequeños, musgos, la tierra de las bromelias y las flores más raras, el reino de los helechos gigantes y las orquídeas, cuyo grupo consigue hasta 200 especies, sobresaliendo las mágnificas wakanki y wiñay wayna.
Área urbana: alcanza el área del parque de Machu Picchu con parcelas, rurales, urbanas y arqueológicas de la ciudadela como también sus alrededores, en un área de 10 hectáreas. En esta localización se encuentra el Santuario Histórico de Machu Picchu, la cual llega hasta la localidad de Urubamba, provincia de Cuzco, al fondo de los valles y bajo el resultado térmico de los recorridos de agua , los bosques de la ceja de montaña ofrecen las condiciones ideales para una gran variedad de cultivos: coca, achiote, maíz, cacao, café y frutales, que fue la despensa de los incas.