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La flora bacteriana, es el conjunto de bacterias que habitan en el organismo, particularmente en piel y mucosas, en estado normal, sin ocasionar algún tipo de enfermedad.
La importancia de la flora bacteriana radica en que desempeña una importante barrera de defensa para el organismo.
En el caso del intestino grueso, lugar con el mayor ecosistema microbiano del organismo, la flora bacteriana contribuye principalmente al correcto funcionamiento de la mucosa intestinal, realiza efecto de barrera contra bacterias patógenas, favorece la producción de IgA como estímulo antigénico, entre otros.
De existir alguna patología que altere el estado de la flora bacteriana normal, pueden ocurrir diversas enfermedades intestinales oportunistas y graves que pueden llegar a causar la muerte.